1.濾材的選用
　　首先按照所要過濾的流體化學名稱，依化學配合禁忌找出可用的濾材，再針對其操作溫度，操作壓力，酸堿值，操作條件(如，是否須要耐受蒸汽，熱水或化學品殺菌等)，逐一評估，并剔除不適用之濾材。 用途也是一個重要的考慮因素，比方藥品、食品或化妝品用之濾材必須是FDA準許的材質；超純水則須挑選純凈、不含有釋出物會影響比阻抗的濾材；過濾氣體則須挑選疏水性材質以及是否需要"衛生級過濾"設計等等。
　　2.過濾精密度
　　這是一個最令人困擾的問題。比方，要除去肉眼可見的顆粒，要選用25微米過濾器；要除去液體中云狀物，要選用1或5微米過濾器；要濾除最小的細菌則需0.2微米的過濾器。 問題在于有兩種過濾精度單位：絕對精度／公稱精度.
　　絕對精度／公稱精度
　　絕對精度是指能100%濾除所標示精度之顆粒。對任何一種過濾器而言，這幾乎是一個不可能達到，而且不實際的標準，因為100%是一個無窮大的值。市面上通稱的絕對過濾器如薄膜等，嚴格地說，只能稱"趨近于絕對"的過濾器,而其它則皆屬于公稱精度，公稱精度，這才是主要的困擾所在:"公稱精度并沒有一個業者共同認定并遵行的標準"。也就是說甲公司可以把公稱精度訂在85-95%，而乙公司卻寧可訂在50-70%。換句話說，甲公司的25微米過濾精度可能等于乙公司的5微米，或者更細。對此問題，有經驗的專業過濾器供應商會有助于過濾精度之選擇，而根本解決之道是"試用"。
　　3. 依照過濾溫度時的粘度，專業過濾設備供應商可以計算出需要多大的過濾器，濾袋承擔多大的流速以及預測其初期壓降若干。若能提供流體中雜質含量，甚至可以預估其過濾壽命。
　　4. 過濾系統之設計 
　這個標題牽涉范圍較廣，比方應該選用那一種壓力來源，需要多大的壓力，是否需要裝兩套過濾器并聯，以適合連續性操作之系統，對粒徑分布寬廣的場合應如何搭配粗濾與精濾，系統中是否須要裝逆止閥或其他裝置等等。這些都需要使用單位與過濾器供應商密切配合，共同找出最恰當的設計。
　　5. 濾袋的使用方式
　　濾器密閉過濾：濾袋與配套過濾器同時使用，利用系統流體壓力，將液體擠壓通過濾袋，以達到過濾的目的。具有流速快，處理能力大，濾袋使用壽命長的優點，特別適應大流量需密閉過濾的場合。 自流開放過濾：濾袋通過適合接頭直接與管道相連，得用流體重力壓差進行過濾。其顯著特點是無需設備投資，過濾簡單可行，特別適用于小規格、多品種、間歇式的經濟型液體過濾。

　　表面過濾與深度過濾的區別
　　表面過濾主要采用篩網材料，深度過濾則采用毛氈材料，它們的區別如下： 
　　1．篩網材料（尼龍單絲、金屬單絲）將過濾中雜質直接截留在材料表面。優點是單絲結構可反復清洗，消耗成本較低；而缺點是表面過濾模式，易造成濾袋表面堵塞，該類型產品最適用于精度較低的粗濾場合，過濾精度25-1200μm。
　　2．毛氈材料（針刺布、溶吹無紡布）是常見的深層三維過濾材料，其特點是纖維組織疏松，高空隙率增加了雜質的容截量，該種纖維材料系屬復式截留模式，即較大的顆粒雜質被截留在纖維表面，而細微顆粒則被捕捉于濾材深層中，因此過濾具有較高過濾效率，此外高溫表面熱處理，即應用瞬間燒結技術，能有效地防止過濾時纖維受流體高速沖帶而散失；毛氈材料是屬于丟棄型的（一次性使用），過濾精度1-200μm。